Vih, immunite et sida introduction





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PREPA AGREG SVTU- secteur A - V.GUILLAUME – leçon VIH et système immunitaire



Préparation à l’Agrégation SVTU - secteur A

Janvier 2005



vih, immunite et sida






INTRODUCTION :





  • Bref historique :

1981 : observation chez de jeunes homosexuels (New-York et Californie) d’une augmentation d’infections opportunistes (pneumocytoses, de Sarcomes de Kaposi…). Mise en évidence du déficit immunitaire résultant d’une diminution significative du nombre de LT CD4+.

1983 : Découverte du virus impliqué : un rétrovirus, le VIH

2003 : le VIH a infecté plus de 50 millions de personnes à travers le monde dont 1/3 sont mortes.


  • VIH 1 et VIH 2 : des rétrovirus.

Rétrovirus : virus à ARN transcrit lors de la phase de réplication virale en ADN « proviral » par la transcriptase inverse et intégré dans le génome de l’hôte. La sous-famille des lentivirus comprend le VIH 1, le VIH 2 et le SIV (Simian immunideficiency virus responsable d’une infection type SIDA chez le macaque), tous cytopathiques.


VIH 1

VIH 2

  • présent en Centre Afrique, Amérique, Europe, Asie …

  • infecte l’Homme et le Chimpanzé

  • plus pathogène et à développement rapide

  • présent en Afrique de l’ouest

  • infecte l’Homme, le Chimpanzé, les macaques, … (plus proche de SIV)

  • moins pathogène et à développement lent

Seulement 40 à 50 % d’homologie de séquence


Il existe de nombreux groupes et sous-groupes de VIH (identifiés par des lettres : type B très répandu en Europe, type C prédominant en Afrique…)
VIH (virus de l’immunodéficience humaine ) : virus touchant le système immunitaire induisant une immunodépression et ouvrant ainsi la porte à des infections opportunistes. Responsable du SIDA (syndrome d’immunodéficience acquise) qui se déclare en moyenne 10 ans après l’infection.
Que sait-on aujourd’hui du virus 20 ans après sa découverte ?

Pourquoi une telle mortalité ? Pourquoi notre système immunitaire ne parvient-il pas à éliminer le virus ?

A l’heure actuelle comment peut-on lutter contre ce virus ? Comment aider notre système immunitaire à se défendre contre le VIH ?
I . Au niveau moléculaire et cellulaire : interactions virus cellules et molécules du système immunitaire

II. Au niveau de l’organisme : étapes de l’infection, réponse du système immunitaire et échappement du virus

III. Au niveau humain : chimio- et immunothérapie, difficultés de mise en œuvre, essais, espoirs.

I. LE VIH ET SA MULTIPLICATION DANS LES CELLULES DU SYSTEME IMMUNITAIRE


1°) L’organisation du virion

1.1 La nucléocapside

Constituée de :  2 molécules d’ARN simple brin de polarité + reliées entre elles par des liaisons hydrogène en 5’ et associées à la transcriptase inverse, la protéase et l’endonucléase-intégrase.

Protéines de nucléocapside directement liées au génome viral (P7 et P9)

Capside en forme d’obus (P 24)

 Matrice protéique (P17 et P18) entourant la capside.

1.2 L’enveloppe

Double couche de phospholipides contenant des glycoprotéines gp 120 et gp 41 transmembranaires


Fig.1 : Structure de la particule virale

D’après « Immunobiology » de JANEWAY et TRAVERS


ARN

Nucléocapside

Enzymes

capside

matrice

Bicouche de phospholipides

gp 120

gp 41


1.3 Le génome viral

9749 nucléotides présentant à chaque extrémité des LTR (répétitions terminales longues). Ces LTR contiennent les signaux pour la transcription, la traduction et l’empaquetage du génome viral. Ils sont modifiés au cours de la synthèse de l’ADNc double brin. L’intégrase catalyse l’intégration du génome viral dans le génome de la cellule cible au niveau des LTR.


9749 nucléotides


gène

Signification du sigle

Facteurs protéiques codés par le gène

gag

Group specific antigen

protéines p17 (protéine de matrice) ; p 24 (protéine de capside) et p7, p9 ( protéines de la nucléocapside)

gag-pol

Polymerase

enzymes : transcriptase inverse, intégrase et protéase virale

env

Enveloppe

glycoprotéines d’enveloppe (gp 120 et gp 41)

tat

Transactivateur

Régulateur positif de transcription

rev

Regulator of viral expression

Régulateur positif permettant l’export de transcrits non épissés hors du noyau

nef

Negative regulatory element

Protéine à fonctions régulatrices variées (permet une bonne production virale, interagit avec de nombreux facteurs cellulaires…)

vif

Viral infectivity

Facteur de maturité et morphogenèse du virus

vpr

Viral protein R

Activateur de la production et de la réplication du virus

Vpu*

Viral protein U

Facteur augmentant l’infectivité dans les LT CD4+

 : gène spécifique de VIH 1 ; VIH 2 possède vpx



Fig.2 : Organisation du génome du VIH 1

D’après « Immunobiology » de JANEWAY et TRAVERS )


2°) Le cycle de multiplication

2.1 Fusion et pénétration du VIH dans les cellules :

Récepteur : CD4 exprimé par les LT helper CD4+ et aussi sur macrophages, cellules dendritiques, cellules de Langerhans de la peau … Interaction avec gp 120 du virus
Corécepteurs : exp : Des cellules n’exprimant que le CD4 ne permettent pratiquement pas l’entrée du virus. Un co-récepteur est nécessaire. Il s’agit de récepteurs aux chimiokines

Chimiokines : petites protéines (8-10kDa) impliquées dans le recrutement des cellules immunitaires sur les sites inflammatoires. On distingue les α- (CXC) et les β- chimiokines(CC). Leurs récepteurs présents sur les cellules du système immunitaire sont des protéines à 7 domaines transmembranaires couplées aux protéines G.

Les principaux co-récepteurs sont les CCR5 et CXCR 4. Ainsi une mutation au niveau du CCR5 confère chez certaines personnes une résistance à l’infection virale.

Autres « récepteurs » d’entrée : l’entrée dans les macrophages se fait via les complexes Anticorps/virus endocytés au niveau de la région Fc des immunoglobulines. Les galactocérébrosides peuvent aussi permettre l’entrée des virus dans les cellules épithéliales (mais moins efficacement).
 Mécanisme de pénétration du VIH :


Fig.3 : Fusion et entrée du VIH dans une cellule cible

D’après « Inhibiteurs d’entrée du VIH » par J.REYNES, Biofutur 226-227 Oct-Nov 2002




Etape 1

Etape 2

Etape 3

2.2 Transcription inverse et intégration du génome viral 

La transcriptase inverse permet de catalyser la synthèse d’une molécule d’ADN double brin à partir d’un ARN simple brin +, celui-ci n’étant pas utilisé comme messager mais comme matrice pour la transcription inverse.


A
Activité transcriptase inverse

Activité ADN polymérase ADN dépendante

Activité RNAse H (hydrolyse hybride ARN/ADN)
RN + ADN simple brin ADN double brin


Pas d’activité de relecture


L’intégration dans le génome viral est catalysée par l’intégrase virale après migration de l’ADN double brin dans le noyau. Cette intégration est non spécifique (aléatoire) mais se fait dans des zones « actives » du noyau.

Le génome intégré est appelé PROVIRUS.
Remarque : les mécanismes moléculaires de transcription inverse et intégration ne sont pas au programme.
2.3 Expression du génome viral

Elle est activée par des facteurs cellulaires et viraux.

Une phase d’expression précoce permet la synthèse des protéines régulatrices tat, rev et nef.

Puis une phase d’expression retardée permet la synthèse des protéines de structure et de régulation.

Caractéristiques de l’expression :

- les machineries de transcription /traduction sont cellulaires, ce qui suppose que la cellule est métaboliquement active

- épissage différentiel

- modifications post-traductionnelles : clivage de polyprotéines.

Des ARN de polarité + issus de transcription sont également formés pour servir de génomes viraux.
2.4 Assemblage et libération des virions

Au niveau de la membrane plasmique : assemblage, bourgeonnement et libération des virions.


Fig. 4 : Cycle de multiplication du VIH dans un LT CD4+. D’après « HIV 1 pathogenesis» de M.STEVENSON – Nat. Med. vol. 9-7-2003


3°) Facteurs régulateurs du cycle viral

3.1 Facteurs régulateurs viraux

Le promoteur viral est un promoteur faible dans les LT quiescents par contre lors de l’activation des LT, le facteur NFB formé active le promoteur du VIH.

Tat est un activateur

Rev active la synthèse des protéines de structure et inhibe celle des protéines régulatrices tat et rev : ce mécanisme de régulation est à la base du passage de la phase précoce à la phase retardée de l’expression.
3.2 Facteurs régulateurs cellulaires 

Ils sont nombreux, positifs ou négatifs. Beaucoup d’études à l’heure actuelle portent sur ces facteurs cellulaires car ce sont des cibles potentielles d’inhibition de la réplication virale.
ex : Cyclin T1 se fixe à tat et augmente l’efficacité de la transcription.

CEM-15 (une protéine impliquée dans l’épissage) inhiberait l’épissage de l’ARN viral mais Vif empêcherait cette inhibition.


( D’après « HIV 1 pathogenesis» de M.STEVENSON – Nature Med. n° 7 juil. 2003)


4°) Variantes cellulaires des cycles viraux


4.2 Dans un Lymphocyte T CD4+ AU REPOS

4.1 Dans un Lymphocyte T CD4+ ACTIVE

4.3 Dans un MACROPHAGE

4.4 Dans unE CELLULE DENDRITIQUE


II. L’INFECTION PAR LE VIH ET LA REPONSE DU SYSTEME IMMUNITAIRE

Problème de l’étude au niveau de l’organisme : il n’existe pas de modèle humain d’étude in-vivo. On utilise le Macaque Rhésus infecté par le SIV ou par le HSIV (un virus SIV chimère où quelques protéines ont été remplacées par celles du VIH). Sinon les études se font sur des cellules en culture.
1°) Etapes de l’infection et SIDA

1.1 Contamination

Le virus est retrouvé dans le sang, le sperme, les secrétions vaginales, le lait maternel voire dans le LCR et les secrétions bronchiques. Il peut être exceptionnellement retrouvé à faible dose dans la salive et les larmes.

Les voies de contamination sont donc - sanguine

- néonatale (voie transplacentaire surtout pendant l’accouchement) et post-natale par allaitement

- sexuelle (vaginale ou anale)
1.2 Primo-infection (infection aigue)

Elle est symptomatique chez plus de la moitié des personnes contaminées. Les premiers symptômes apparaissent 10 à 15 jours après l’infection et ressemblent à ceux d’une mononucléose infectieuse :

-fièvre

- maux de tête

- asthénie, amaigrissement

- éruption cutanée

- troubles digestifs (diarrhées…)
Le nombre de LT CD4+ diminue beaucoup pendant cette phase qui peut durer 2 semaines.

1.3 Phase asymptomatique

2 semaines à quelques mois après la contamination, des anticorps anti-VIH peuvent être détectés dans le sang : la personne est alors dite SEROPOSITIVE pour le VIH. Des LT CD8+ cytotoxiques anti-VIH sont aussi produits.

Pendant cette phase asymptomatique qui peut durer en moyenne 6 à 15 ans (si personnes non traitées), les virus se multiplient et le nombre de LT CD4+ diminue lentement. Le système immunitaire répond à l’infection et la contient.
1.4 Phase symptomatique

Elle est caractérisée par un nombre de LT CD4+ qui devient inférieur à 500 par L de plasma.

On parle alors de lymphadénopathie persistante généralisée.

L’affaiblissement du système immunitaire ouvre la porte à de nombreuses infections opportunistes.
1.5 Phase SIDA

Elle est atteinte quand le nombre de LT CD4+ qui devient inférieur à 200 par L de plasma.

Elle est caractérisée par

-
Fig.7 : Infections opportunistes et cancers liés au SIDA

D’après « Immunobiology » de JANEWAY et TRAVERS )

des signes liés au virus : perte de poids, fièvre, diminution des LT, LB, macrophages, cellules dendritiques …

- des signes liés à l’immunodéficience : apparition de cancers, tuberculoses, zonas, pneumopathies, dégénérescences neurologiques…
2°) Transmission et dissémination du virus

2.1 Transmission et passage de la barrière muqueuse

Cas de la muqueuse vaginale (épithélium stratifié) et cervicale (épithélium à une seule couche de cellules).


Fig.8 : Premières étapes de l’infection par le VIH

D’après « HIV 1 pathogenesis» de M.STEVENSON – Nature Med. n° 7 juil. 2003


2.2 Propagation locale et atteinte du ganglion lymphatique drainant

2.3 Dissémination systémique


Fig.9 : dissémination du VIH dans l’organisme

D’après « HIV 1 pathogenesis» de M.STEVENSON – Nature Med. n° 7 juil. 2003




3°) Mécanismes de cytopathogénicité

3.1 Sur les lymphocytes T CD4+ infectés

Indirectement : les LT CD4+ infectés sont lysés par les cellules LT CD8+ (réponse immunitaire à médiation cellulaire)

Directement : le virus infectant induit l’APOPTOSE des cellules qu’il infecte via Vpr.
3.2 Sur les autres lymphocytes 

In vitro : des LTCD8+ et des LTCD4+ non infectés par VIH mais issus de personnes séropositives entrent plus facilement en apoptose.
In-vivo : des cellules non infectées dans les ganglions lymphatiques de personnes atteintes peuvent entrer en apoptose.
VIH est capable d’induire l’apoptose de lymphocytes sans les infecter ! (via la voie Fas-Fas L. Nef intervient dans ce mécanisme).
3.3 Sur d’autres cellules

Les macrophages contenant le virus sont lysés.

Les cellules du système nerveux central telles que les neurones, les astrocytes,…subissent également une apoptose (d’où les atteintes neurologiques associées au SIDA).

Remarque : les études sur les mécanismes de cytopathogénicité sont encore très incomplètes voire contradictoires ! La difficulté vient des très divers types cellulaires à étudier, des nombreuses voies d’apoptose mises en jeu, des systèmes d’étude in-vitro très variés, de la variabilité des isolats de VIH1…
4°) Réponse immunitaire anti-VIH

Il existe une réponse immunitaire non spécifique classique au niveau des muqueuses cependant elle est efficace contre le virus libre or le virus entre très rapidement dans les cellules du système immunitaire.

Pourtant chez certaines personnes à risque (cohorte de prostituées en Afrique) présentant un très fort taux d’anticorps anti-VIH au niveau de la muqueuse vaginale, on observe une protection par rapport à l’infection. Mais cette protection ne semble durer qu’un temps.
4.1 Nature de la réponse immunitaire 

a) Humorale

Suite à l’infection des anticorps anti-VIH sont détectés. Il s’agit d’anticorps dirigés contre de nombreux épitopes du virus, les plus neutralisants étant - les anti-glycoprotéines d’enveloppe (3e boucle hypervariable),

  • les anti-gp 120

  • et les anti-gp41.

Ces anticorps ne sont en fait que peu neutralisants. Une injection intraveineuse d’anti-VIH à une personne infectée ne montre qu’une très faible diminution de la charge virale et n’empêche pas la progression de la maladie.




b) Cellulaire

Importance de la réponse cellulaire pour contenir l’infection (fig 11).
Les LT CD8+ sont retrouvés en grande quantité  dans de nombreux compartiments cellulaires de personnes infectées.

C’est en fait surtout la réponse cellulaire cytotoxique qui permet de faire chuter la virémie après la phase précoce d’infection. Par la suite cette réponse cellulaire contribue malheureusement aussi à lyser les cellules infectées et à induire l’immunodépression.
4.2 Variabilité de la réponse immunitaire

Les aspects génétiques semblent intervenir notamment la nature des allotypes des molécules du CMH 1. Certains allèles seraient plus susceptibles d’intervenir dans la présentation des antigènes viraux et d’induire une bonne réponse immunitaire.
5°) Echappement du virus au système immunitaire

5.1 Echappement au système immunitaire non-spécifique : Spicules épitopiques masquées par des glycosylations (mauvaise reconnaissance par les anticorps), inhibition des NK, et surtout virus très vite masqué dans les cellules dendritiques…

5.2 Echappement à la réponse à médiation cellulaire : élimination des LT CD8+, inhibition de l’expression en surface des molécules du CMH1 (rôle de Nef, de Vpu) , mutations portant sur les peptides antigéniques exprimés en surface des cellules infectées (fort taux d’erreurs de la transcriptase inverse).

5.2 Echappement à la réponse à médiation humorale : Glycosylation des protéines de surface, mutations au niveau des gènes des protéines de surface, accessibilité limitée (réservoirs cellulaires et tissulaires),…

III. CHIMIO- ET IMMUNOTHERAPIE ANTI-VIH

Aujourd’hui le développement et l’utilisation de traitements anti-VIH a transformé cette infection en une maladie infectieuse chronique. On parvient à diminuer considérablement la charge virale et à prolonger la survie.

1°) Chimiothérapie anti-VIH

1.1 Diversité des anti-VIH : inhibiteurs de la transcriptase inverse (compétitifs tels que l’AZT ou non compétitifs), inhibiteurs de la protéase,

Inhibiteurs de l’intégrase

et nouvelle classe d’inhibiteurs de fusion (blocage de la fusion virus/ cellule)


LT CD4+

Structure en épingle à cheveux, fusion et entrée du virus

Le peptide T20 empêche le changement de conformation

La fusion est empêchée, le virus n’entre pas



Fig.12 : Mécanisme d’action de T20, un inhibiteur de fusion

D’après « 20 years of therapy for HIV 1 infection» de R.POMERANTZ – Nat. Med. n° 7 juil. 2003



1.2 Limites de la chimiothérapie anti-VIH

- Apparition de résistances : d’où l’utilisation de drogues en trithérapie

- Complications métaboliques et effets secondaires importants

- traitement lourd : prise quotidienne importante tant en quantité qu’en fréquence

- difficulté pharmacologique : difficile de trouver de nouvelles drogues capables d’aller dans tous les compartiments cellulaires où se trouve le VIH, de plus, accessibilité de la cible délicate.

- coût des traitements : pris en charge en France par la Sécurité Sociale à 100%. Environ 10 000 euros par an et par personne sous traitement. Tous les pays ne peuvent évidemment pas supporter le coût de ces traitements.
1.3 Succès de la chimiothérapie anti-VIH

- transmission mère - enfant : le traitement préventif antirétroviral d’une future mère permet aujourd’hui de protéger l’enfant dans 98% des cas (dans les pays riches).

- Diminution de la charge virale : cela permet de prolonger la survie (protection individuelle) mais aussi de diminuer les risques de transmission, celle-ci étant dose-dépendante lors d’un contact (protection collective).

- traitement préventif après une exposition : type pilule du lendemain. Préconisé en milieu hospitalier en cas d’accident ou après un viol. Pas de réelles preuves actuellement d’une vraie efficacité.
2°) Immunisation thérapeutique et vaccination

Deux stratégies vaccinales peuvent être envisagées : - un vrai vaccin (donc préventif)

- un vaccin "thérapeutique" permettant d’améliorer la réponse immunitaire chez les personnes infectées. Ce type de vaccin ayant un meilleur avenir. Plusieurs essais en cours (phase III ).

2.1 Approche humorale et cellulaire

Basée sur le principe de la vaccination.

Approche humorale (stimulation de la production d’anticorps) peu efficace.

Approche cellulaire (stimulation de la synthèse de LTCD8+spécifiques du VIH) plus recherchée : cela nécessite d’induire une activation qui passe par l’expression en surface d’une cellule présentatrice d’antigène de fragments antigéniques viraux.

2.2 Difficultés d’élaboration d’un vaccin 

Le virus naturellement n’induit pas d’antigène suffisamment protecteur, nombreuses stratégies d’échappement au système immunitaire, mutation très rapide des virus (épitopes changeants, souches d’un individu infecte sont en plus différentes de celles utilisée en laboratoire), réservoirs cellulaires et tissulaires difficiles d’accès…

Plus les problèmes économiques, éthiques sur les essais, politiques…
2.3 Stratégies vaccinales

a) Vaccins déclenchant la production d’anticorps : échecs avec anti-gp 120. On s’intéresse maintenant aux vaccins avec des anticorps neutralisants des muqueuses.

b) vaccins déclenchant des réactions cellulaires

  • vecteur vaccinal vivant : canarypox, le virus de la variole du canari qui est capable de commencer sa réplication chez l’homme mais ne peut pas faire un cycle complet. On lui ajoute certains gènes du VIH. Essais aussi avec des vecteurs adénoviraux (encourageants) ;

  • ADN nu : bons résultats chez le Singe, moins bons chez l’homme. Pourrait fonctionner en association.

  • Lipopeptides viraux : peptides de 30 à 40 acides-aminés correspondant à des épitopes du virus auxquels on ajoute des lipides afin de permettre leur entrée directement dans les CPA (cellules présentatrices d’antigènes). Semble bien fonctionner (essais phase II), les LT CD8+ reconnaissent les peptides et s’activent.

c) vaccins déclenchant l’immunité humorale et cellulaire : combiner les deux serait sûrement plus efficace.



Fig.19 : Stratégies vaccinales (fin 1998)

D’après « Les vaccins contre le SIDA : espoirs et défis » D.BALTIMORE-Pour La Science n°251 sept 1998 )



2.4 Bilan : à quand un vaccin anti-VIH ?

D’après directeur de l’Agence Nationale de Recherche sur le SIDA (2004) :

vaccin thérapeutique sans doute pas avant 2007, car peu de tests en phase III. La dernière étude en Thaïlande d’essais en phase III n’avait eu aucun succès. Les vaccins thérapeutiques viendront sans doute à l’appui des traitements anti-rétroviraux. Le but n’étant pas de soigner mais de prolonger la survie. De toute façon il se posera toujours un problème économique et politique.
3°) Prévention de l’infection

3.1 Prévention classique

Elle reste la meilleure arme contre le virus

3.2 Microbicides

80% des personnes infectées le sont par transmission sexuelle au cours de rapports non protégés. L’idée est de fabriquer des microbicides vaginaux notamment pour les pays en voie de développement.

Exemple de microbicides possibles :

  • ceux maintenant le pH acide. Normalement le pH vaginal acide inhibe le virus mais le sperme alcalinise le milieu.

  • Les inhibiteurs chimiques antiviraux

  • Ceux utilisant des antirétroviraux,

  • Ceux contenant des leurres de gp 120…

Ces produits doivent être inoffensifs et ne pas léser l’épithélium vaginal ou cervical (sinon on favorise l’entrée du virus !). Ils doivent être d’utilisation aisée et peu chers. Actuellement peu de firmes pharmaceutiques s’intéressent aux microbicides : ils ne seraient pas assez rentables … !

CONCLUSION :

20 ans de travail sur VIH, presque 200 000 articles scientifiques sur le sujet, et pourtant l’épidémie progresse.

Le SIDA grâce aux traitements est devenue une maladie chronique persistante, l’objectif étant de prolonger la vie des personnes infectées.

La difficulté d’étude de ce virus est liée surtout au fait qu’il s’attaque directement au système immunitaire et qu’il mute très rapidement : Quelles souches aurons-nous dans 10 ou 20 ans ?

Les très nombreuses personnes infectées, immunodéprimées constituent un réservoir pour les infections opportunistes dues aux bactéries, champignons, protozoaires ou virus. Actuellement on constate une recrudescence de maladies opportunistes telles que la tuberculose …

BIBLIOGRAPHIE : voir biblio sur VIH donnée par Laurence Poitou en cours de microbiologie.

Principaux livres consultés :


    • « Les virus » Th.BORREL, coll 128 Nathan, 1996

    • « Virologie générale et moléculaire » GIRARD et coll., Doin, 1989

    • « Les virus », H.TERZIAN, Diderot, 1998

    • « Immunobiology », JANEWAY et TRAVERS, seconde édition, Churchill Livingstone, 1997



Principaux articles et dossiers spécialisés (parmi les plus récents) :


    • « 20 years of HIV science » Nature Medecine, vol. 9 n°7 juillet 2003

    • « VIH, 20 ans après » Biofutur, n°226/227, oct/nov 2002

    • « Le combat contre le SIDA », Pour la Science n0251 sept.1998

    • « Stratégies d’échappement au système immunitaire du VIH » Médecine-Science, aout/sept.1999



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