CURRICULUM VITAE Hanen Ben Hassen Masmoudi hanen.masmoudi@cbs.rnrt.tn (0016) 97 237 504 CHAMPS DE COMPETENCES
Analyse de données liées à différents domaines biologiques (nutrition, microbiologie, immunologie, physiologie et biologie animales et végétales, toxicologie, génétique, biologie cellulaire, …)
Modélisation de données Biologiques
DIPLOMES
Thèse de Doctorat en Sciences Biologiques, spécialité Biostatistique/Bioinformatique (université de Sfax, 08/09).
Dirigée par Pr. Ahmed Rebai
Titre : Etude Biostatistique des voies de signalisations cellulaires : application dans le domaine biomédical
Diplôme de mastère en Biologie et Santé, spécialité Bioinformatique (université de Monastir, 04/05).
Dirigé par: Maher Trigui, phd
Titre : Applications des Réseaux de neurones dans le traitement thermique des produits alimentaires.
Maîtrise en sciences naturelles (université de Sfax, 2000).
PUBLICATIONS
Ben Hassen, H. Masmoudi, A. and Rebai, A. (2008). Causal inference in
Biomolecular Pathways using a Bayesian network approach and an Implicit method.
J. Theor. Biology. 4, 717-724.
Ben Hassen H, Masmoudi A, Rebai A. (2009). Inference in signal transduction pathways using EM algorithm and an Implicit algorithm: Incomplete data case. Journal of Computational Biology., 16(9): 1227-1240.
Kallel-Bayoudh I, Ben Hassen Hanen, Khabir A, Boujelbene N, Daoud J, Frikha M, Sallemi-Boudawara T, Aifa S, Rebaï (2011). A Bcl-2 expression and triple negative profile in breast carcinoma. Med Oncol. 28:S55–S61.
Hanen Ben Hassen, Lobna Bouchaala, Afif Masmoudi and Ahmed Rebai. (2010) Learning Structure and Parameters in Bayesian Networks Using an Implicit Framework, Bayesian Network, ISBN 978-953-307-124-4.
Hanen Ben Hassen, Imen kallel, Lobna Bouchaala and Ahmed Rebai (2010) Réseaux Bayesiens pour le pronostic du cancer du sein, JFRB..HAL :hal-00466896, version 1.
Karim ennouri, Hanen Ben Hassen and Nabil Zouari. (2012). Réseaux Bayesiens pour l’étude du milieu de culture et des principaux produits finaux de fermentation de Bacillus thuringiensis. Procédés 6èmes journées francophones sur les réseaux Bayesiens, pages 41-46.
Monia Ennouri, Bassem Khemakhem, Hanen Ben Hassen, Imen Ammar, Karima Belghith and Hamadi Attia. (2012) Purification and characterization of an amylase from Opuntiaficus-indica seeds. Journal of the Science of Food and Agriculture, DOI: 10.1002/jsfa.5731
J’ai présenté des communications orales dans des congrès internationaux :
Communication orale intitulée ” Implicit Network: An alternative to Bayesian Networks for modelling signal transduction pathways “ (The first Tuniso-Almend meeting of Bioinformatics (Borjesedria, Tunisie Septembre 06)).
Communication orale intitulée ” Learning Implicit Networks” (The first meeting of Bioinformatics (Tangier, Maroc Novembre 06)).
Communication orale intitulée ” Learning Probabilities in an Implicit Network ” (The Workshop on statistical Analysis of post Génomic data (Paris, France Janvier 07)).
Communication orale intitulée ” Estimation of missing data by Implicit networks and application in biology” (The second Mediterranean conference in applied mathematics (Monastir, Tunisie Mars 07)).
Bioinformatic Methods for the prognosis of breast cancer (Symposium Tuniso- Japanese (TJASSST 10) (Hammamet, Septembre, 2009))
Prédiction des points critiques dans la méthode HACCP par l’utilisation d’un modèle de réseau de neurones (Première journée scientifique sur la valorisation des Bioressources à intérêt Alimentaire (Monastir, mai 2010))
Réseaux Bayesiens pour le pronostique du cancer du sein (5èmes journées francophones sur les réseaux Bayesiens (Nantes, Mai 2010))
Bayesian networks for breast cancer prognosis and prediction of metastasis risk ( International Conference on Mathematical Methods and Models in Biosciences: Biomath (Bulgaria, June 2011)).
ACTIVITÉ PROFESSIONNELLE
Enseignement des cours, travaux dirigés et pratiques de Bioinformatique et de Biostatistique à l’institut supérieur de Biotechnologie de Sfax (Depuis 2009 . (Assistante))
- travaux pratiques de biologie végétale,
- travaux pratiques et dirigés de Biostatistique
- travaux pratiques de Bioinformatique
- travaux pratiques de microbiologie
- travaux pratiques techniques de production alimentaire.
à l’institut supérieur des sciences appliquées et technologie de Mahdia pour l’année universitaire depuis 05/06 jusqu’à 08/09 (Contrat assistant). FORMATION
Formation de Biostatistique intitulée : Biostatistique pour la médecine (Février 07)
Séminaire atelier sur : Evaluation du statut HER2 en Cancérologie ; Méthodes et Applications cliniques. (Janvier 2006).
Formation pédagogique sur les thèmes suivants : La pédagogie des mathématiques dans l’enseignement supérieur, la gestion des conflits avec les étudiants, les enquêtes sur l’insertion professionnelle des étudiants comme garantie de la qualité de l’enseignement et la communication interpersonnelle entre les étudiants et professeurs dans l’enseignement supérieur. (Février 2006).
Participation au 2ème forum de la recherche médicale organisé à la faculté de médecine de Sfax et à toutes les sessions scientifiques du forum. (Avril 2008).
Participation au cours international de bioinformatique organisé par EMBO au Brésil (Juillet 2008).
Participation au workshop : Separation science and the Omics (sessions théoriques et pratiques) Pakistan (Avril, 2009)
Participation à la formation pédagogique au sein du rectorat de Sfax, durant l’année universitaire 2009/2010.
Participation to the EMBO Global Exchange Lecture Course on Bioinformatics and Comparative Genome Analysis (Tunis, December 2010).
Journées, Réseaux Bayesiens et Applications (Sfax, Janvier 2010)
Première journée scientifique sur la valorisation des Bioressources à intérêt Alimentaire (Monastir, mai 2010)
5èmes journées francophones sur les réseaux Bayesiens (Nantes, Mai 2010))
Workshop, Experion de BIO-RAD et Application sur le Genotypage de l’ADN et la Séparation des proteines (ISBS, Sfax Mai 2010)
International Conference on Mathematical Methods and Models in Biosciences: Biomath (Bulgaria, Juin 2011).
Journées, Réseaux Bayesiens et Applications (Sfax, septembre 2011).
6èmes journées francophones sur les réseaux Bayesiens (Sfax, Mai 2012))
THEMES DE RECHERCHE
- Modélisation et prédiction des voies de signalisation cellulaires
- Méthodes statistiques, Réseaux Bayesiens, apprentissage
- Analyse et modélisation de données Biologiques.
AUTRES INFORMATIONS
- Membre du comité d’organisation des journées Réseaux Bayesiens et Application 2010
- Membre du comité d’organisation et scientifique des journées Réseaux Bayesiens et Application 2011.
- Membre du comité d’organisation des 6èmes journées francophones sur les réseaux Bayesiens (Sfax, Mai 2012))
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